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David Baker的AI创新药企CHARM Therapeutics的团队搭建

小王随笔 小王随笔 2023-01-13
收录于合集 #生医行业观察 20个
前几天（2022.6.9），一家英国的初创 AI 创新药企获得A轮5千万美元融资的新闻引起了中文互联网的关注，也引起了笔者的兴趣。原因如本文的标题所示，这是 David Baker 的公司。

关于这家初创 AI 创新药企的新闻，请参考 Medaverse 的这篇对 CHARM Therapeutics 的官网介绍的翻译：
David Baker教授创立，蛋白质折叠预测新锐完成5000万美元A轮融资
CHARM Therapeutics 正在开创端到端的3D深度学习，以发现和开发针对以前难以成药靶点的转化药物。该公司的专有平台DragonFold运用蛋白质-配体共折叠方面的专业知识，提供针对癌症和其他疾病领域具有挑战性的成药靶点的转化药物。可以基于蛋白质的一级序列和配体的化学结构预测蛋白质-配体复合物的共晶结构。目前公司刚创立，产品管线还没有披露。
Medaverse


https://charmtx.com

从创始人 Laksh Aithani 的 Linkedin 主页上来看，CHARM Therapeutics（下面简称 CHARMTx）是一家去年10月成立的公司，总部设立在伦敦。

两位联合创始人分别是担当CEO的 Laksh Aithani 和没有明确担任职务的 David Baker。

David Baker 当然是现在蛋白质科学领域最大的明星科学家之一，蛋白质设计领域的绝对权威和开疆拓土者，与工业界开发的 AlphaFold2 相抗衡匹敌的 RosettaFold 的项目领航人。感兴趣的读者不妨读小王去年的旧文：
从David Baker的师承聊聊天和号中文操作系统

但是，尽管有剑桥大学优等毕业生的背景（2016 - 2019），以及读研末期创业的经历（AI 网络工具开发，公司名：genei），Laksh Aithani 自身关于 AI 制药的知识和经验应该来自于其在 Exscientia 做实习生和全职工作时，作为机器学习工程师参与了 AI 制药平台的搭建和开发以及分子标靶的发现。他作为 Exscientia 的员工，有一篇2021年发表在 J. Med. Chem. 的文章，位列第二作者。因此，相较而言，Laksh Aithani 是相当 junior 的。


眼下 CHARMTx 所披露的信息太少了，毕竟一家去年10月才注册成立的公司，又能指望它在半年多一点的时间做出什么里程碑或建立什么战略合作关系呢？又不是一些国内的AI公司。

目前唯一丰富的信息是 CHARMTx 官网披露的人员组成，非常透明，非常值得赞赏 —— 所有员工都依照姓的字母顺序排列在网站上。

这不仅能让行业观察者（如小王）一窥公司的发展端倪，也能让初创公司创业人借鉴公司草创阶段的人员架构，更能让投资人了然公司目前的研发人员实力。当然，在早期融资阶段，给潜在的投资人看，可能就是这么做的主要原因。当公司稍具规模后，例如员工总数多于100，在公司网站上放出所有人的资料目录，就显得冗赘而怪异了。况且那时维护网站页面也须投入不小的工作量，不值当了。

小王不带大家看董事会（Board）了，投资人分蛋糕的事小王不懂，直接看 Team（包括 Leadership）。依据 CHARMTx 的官网招聘信息，全职员工 24 人。领导层标红。

创始人
Laksh Aithani, CEO

机器学习（现有8人）
  • Sergey Bartunov, Director, AI 
  • Liam Atkinson, Machine learning engineering manager
  • Eric Alcaide, Machine learning engineer
  • Alwin Bucher, Machine learning engineer
  • Kai Wohlfahrt, Machine learning engineer 
  • Beni Fabian, Machine learning engineer 
  • Adam Klukowski, Machine learning engineer 
  • Peter Mernyei, Machine learning engineer

软件工程（现有3人）
  • Jan Domanski, Software engineering manager
  • Tom Primozic, Senior software engineer 
  • Kostiantyn Lapchevskyi, Software engineer 

生命科学（现有6人）
  • 药物发现
    • Sarah Skerratt, SVP, Head of drug discovery 
  • 结构生物学
    • Andrew S. Doré, VP, Head of structural sciences 
  • 癌症生物学
    • Daniel Rohle, VP, Head of cancer biology
  • 结晶学
    • Prakash Rucktooa, Director, Head of crystallography 
  • 计算化学
    • Xiao Shan, Senior quantum chemistry scientist
  • 生物信息学
    • Finlay MacLean, Bioinformatics data scientist 

职能（现有6人）
  • 人力招聘
    • Matthew Charlton, Head of technical talent acquisition
    • Gaya Nulens, Talent acquisition specialist 
  • 战略与商业发展
    • Zahra Khwaja, Strategy and business development manager
  • 办公室、实验室管理
    • Kerry Evans, Lab and facilities manager
    • Rita Ramnani, Office manager and PA
  • 金融
    • Amar Shah, Founding advisor

总结看，公司目前 1/3 的员工是机器学习算法工程师，如果加上软件工程师和AI算法工程师出身的CEO本人，则恰好一半是 CS/IT 员工；1/4 是生物学或化学家，并且几乎都是各个部门的领导，也就是说先将各部门的 VP、总监等招入，搭起组织架构；1/4 是人力、管理等职能员工。

这支团队很强。

在已经招聘的员工内，小王认为最值得一提的药物发现的高级VP，有机化学家 Sarah Skerratt 博士。Sarah Skerratt 博士毕业于诺丁汉大学，之后在斯坦福大学做了两年的有机合成方向的博后（2002 - 2003），接着在辉瑞的药化部门工作了12年，然后在5年半内接连被渤健、福泰、默沙东聘为化学或药化的 Head。
  • 辉瑞（Pfizer），药物化学，研发科学家至总监（2004.1 - 2016.4）
  • 渤健（Biogen, UK），化学，总监（2016.5 - 2017.5）
  • 福泰（Vertex, UK），药物化学，Head（2017.6 - 2019.2）
  • 默沙东（MSD, London），化学，Head（2019.2 - 2021.12）

这与英矽聘请任峰博士异曲同工。


从 CHARMTx 的招聘信息看，将继续在生命科学（Life sciences）、机器学习与工程（ML & engineering）、职能（Operiations）三个方向招人，除了填充已经搭建起来的部门，例如癌症生物学、晶体学，还将继续招聘总监，扩充方向，重点是药物化学、蛋白质生物化学以及计算化学。

待招聘岗位
  • 机器学习 & 软件工程
    • Director of engineer 
    • (senior) machine learning engineer 
    • platform engineer 
    • research engineer 
  • 药物化学 
    • VP, Head
    • principal scientist 
    • associate principal scientist
  • 癌症生物学 
    • associate principal scientist
    • senior scientist II
  • 晶体学 
    • senior scientist 
    • scientist
  • 蛋白质生物化学
    • director, head of protein sciences 
    • senior scientist, protein expression
    • scientist, biochemistry
  • 计算化学
    • VP, modelling and informatics
    • senior scientist, computational chemistry
  • 职能
    • Financial controller

这样一来，从 CHARMTx 的架构和人员配置来看，公司的研发思路是：
计算：AI + 分子建模、优化、建库、筛选 + 自由能计算
实验：蛋白质与配体的筛选、纯化、表达、结晶 + 体外细胞实验 + CRO 公司动物模型、临床
目标：癌症靶点 + 小分子药物发现

目前，CHARMTx 已经公布的唯一的工具或者成果是采用端到端深度学习训练，能够预测蛋白质与配体的复合体结构的所谓 DragonFold 算法，用于高通量筛选，也就是 AI 驱动或者 AI 加速。

最后，David Baker 是唯一不在 Team 中的公司领导，也不在董事会。所以，应该 Baker 只是提供专利、咨询、广告宣传，占了一些干股的大虎皮。本以为这是 Baker 深度参与的初创公司 —— 国内外新闻标题无一不在标题中加入 David Baker 的名字，现在看，并非如此。

什么时候，David Baker 亲自下场，行业必将掀起龙（dragon）卷（fold）风。

本文完。
2022.6.16 于深圳

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公众号说明
“小王随笔” @xiaowang_essay 是小王的个人号，内容不垂直，目标不明确。本号宗旨：理实交融，益智厚生。内容主要是：科学、科学史等。鉴于小王的价值观：“天不生教员，万古长如夜”，viva la commune，也可能随性写一些激昂文字。又，小王出生成长于东部地区的一个世俗而传统的老回回 muslim 家族，本号也会关注历史、民族学等。干货私货皆有，凭君自取。

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